Después de los doce idílicos meses que han vivido, Javier (Javier Veiga) y Marta (Marta Hazas) ahora se enfrentan a un nuevo reto, la idea de formar una familia juntos. Los dos intentan mantener un equilibrio en su relación para no caer en la monotonía, mientras que buscan la forma de poder tener hijos. Sin embargo, lo que no se imaginan es lo difícil que es ponerse de acuerdo siendo tan distintos el uno del otro y lo complicado que puede resultar convivir con otra persona en la misma casa por mucho amor que sientan hacia su pareja. Esta segunda temporada cambia un poco el formato, realizando más episodios que en la primera entrega, pero con una duración menor, pasando de los cincuenta a los treinta minutos.
La segunda temporada de 'Pequeñas coincidencias' se estrenó en Amazon Prime Video el 15 de enero de 2020 con doce capítulos donde se pudo volver a ver a Mariano Peña, Juan Ibáñez, Xosé Touriñán, Alicia Rubio y Tomás Pozzi junto a los actores principales de la comedia romántica. Durante la temporada dos contó una vez más con cameos y colaboraciones que sorprendieron a los espectadores, pues rostros conocidos de la televisión participaron en el proyecto, como María Barranco, Fele Martínez, Ramón Langa, Sabrina Praga, Pepa Rus, Adrián Lastra, Cristina Pedroche y Marta Santandreu.
Esta era la segunda producción que realizaba Atresmedia Studios desde su creación, en la que participó junto a MedioLimón y Onza Entertainment. Javier Veiga, Miguel Conde y Mario Montero se encargaron de dirigir los diferentes episodios de la serie; además, el creador también ejerció como guionista junto a Gerald B. Fillmore, Cristina Pons, Antonio Muñoz de Mesa, Abraham Sastre y Alberto López. Gracias a la respuesta de los espectadores, la comedia romántica volvió a renovar para una tercera temporada en la plataforma de streaming.