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La cabecera de la temporada 13 de 'Cuéntame cómo pasó' tiene a la cantante Estrella Morente como intérprete, una versión que recupera para la mítica sintonía de la ficción protagonizada por Imanol Arias y Ana Duato ese toque flamenco con el que ya nos sorprendieron tiempo atrás Pitingo y Rosario Flores. La temporada está marcada por la crisis económica que vive la familia Alcántara y que les obliga a cambiar de nuevo su forma de vida y regresar a su antiguo barrio, San Genaro. Ese mismo motivo es el que lleva a Antonio a privarse de sus vacaciones en Sagrillas para no generar comentarios entre sus paisanos. Asimismo, la familia se enfrenta a la enfermedad de Mercedes y a su recuperación, lo que centrará toda la atención de Antonio en su mujer, ayudándole a superar un tratamiento que le deja secuelas para siempre. Además, Carlos abandona el domicilio familiar para marcharse a vivir junto a Arantxa y Felipe, con los que mantiene una relación especial, momento en el que también decide iniciar su propio negocio, un bar de copas. Por su parte, Inés continúa su recuperación de la adicción a las drogas y ejerce de profesora en un taller para ayudar a otras personas con el mismo problema que ella.